RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516697.1

RNU6-180P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 180, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-180P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-180P-201ENST00000516697 MXD3Q9BW11 206 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 STRA6Q9BX79 667 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 HEMGNQ9BXL5 484 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LRRCC1Q9C099 1032 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 WWTR1Q9GZV5 400 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 HOXD1Q9GZZ0 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TKTL2Q9H0I9 626 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 S1PR5Q9H228 398 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLEKHA2Q9HB19 425 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ARNT2Q9HBZ2 717 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 A4GALTQ9NPC4 353 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SMYD2Q9NRG4 433 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RXFP3Q9NSD7 469 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NECAP2Q9NVZ3 263 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RGL1Q9NZL6 768 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ARMCX1Q9P291 453 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FBXL17Q9UF56 701 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RSPH14Q9UHP6 348 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KCND3Q9UK17 655 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FBXL2Q9UKC9 423 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC7A7Q9UM01 511 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PSG11Q9UQ72 335 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OSGIN2Q9Y236 505 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CNPY2Q9Y2B0 182 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM96BQ9Y3D0 163 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 STON1Q9Y6Q2 735 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PIAS3Q9Y6X2 628 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 A3GALT2U3KPV4 340 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MYO10Q9HD67 2058 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF541Q9H0D2 1346 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LTBP1Q14766 1721 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 A0A1B0GTH9 108 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 A0A1W2PPK0 400 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 A0A1W2PQM1 296 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCDC189A1A4V9 331 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PINLYPA6NC86 204 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM231BA6NCW3 169 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TRIM49BA6NDI0 452 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM8BA6NDV4 472 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 POM121BA6NF01 834 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 OR2W5A6NFC9 320 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 MFSD2BA6NFX1 497 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMEM202A6NGA9 273 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 RRN3P2A6NIE6 340 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SHISA7A6NL88 538 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 C15orf61A6NNL5 157 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC38A8A6NNN8 435 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 A8MV72 311 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ISM1B1AKI9 464 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TEX22C9J3V5 150 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NPIPB9F8W1W9 429 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLCO1B7G3V0H7 640 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 H3BQ06 376 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 K7ESF4 209 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SAP18O00422 153 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 WNT9BO14905 357 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TFECO14948 347 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 KPNA5O15131 536 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 VILLO15195 856 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZBTB43O43298 467 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 LRRTM2O43300 516 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 DHHO43323 396 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF749O43361 778 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 THAP12O43422 761 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 NCK2O43639 380 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLPP2O43688 288 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SCO2O43819 266 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMCC2O75069 709 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF253O75346 499 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 AVILO75366 819 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 SH3BGRLO75368 114 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRDM1O75626 825 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 CSPG5O95196 566 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRAMEF12O95522 483 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms