RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514183.5

RACK1-231, Transcript of receptor for activated C kinase 1, human

TSL 2

Gene RACK1, Length 1,439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RACK1-231	ENST00000514183	RELB	Q01201	579 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	BNIP3	Q12983	259 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CTBP1	Q13363	440 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PTPRCAP	Q14761	206 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	DLG2	Q15700	870 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ISX	Q2M1V0	245 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	LAYN	Q6UX15	382 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	USP53	Q70EK8	1073 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SPATA21	Q7Z572	469 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MAPK15	Q8TD08	544 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CALML6	Q8TD86	181 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NAT6	Q93015	286 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	HDAC10	Q969S8	669 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MYO19	Q96H55	970 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GPR22	Q99680	433 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183		A0A096LPK6	155 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	OR51F1	A6NGY5	319 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	AURKA	O14965	403 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SCAMP1	O15126	338 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NDUFB5	O43674	189 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SNX3	O60493	162 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PLIN3	O60664	434 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	HAUS5	O94927	633 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	IGSF6	O95976	241 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	WNT1	P04628	370 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GSTA1	P08263	222 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SRC	P12931	536 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GP1BB	P13224	206 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SAT1	P21673	171 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	DGKA	P23743	735 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	AKT2	P31751	481 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GMPR	P36959	345 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CSNK1D	P48730	415 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	POLD2	P49005	469 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	IRF9	Q00978	393 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ACVR1	Q04771	509 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SLC20A2	Q08357	652 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	NFATC3	Q12968	1075 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	INSC	Q1MX18	579 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CGB2	Q6NT52	195 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	RAPH1	Q70E73	1250 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CLEC14A	Q86T13	490 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ZNF366	Q8N895	744 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	GPATCH11	Q8N954	259 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CCDC63	Q8NA47	563 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	STYX	Q8WUJ0	223 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	PEX13	Q92968	403 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	TMEM159	Q96B96	161 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	ITPKC	Q96DU7	683 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	SGF29	Q96ES7	293 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RACK1-231	ENST00000514183	CABS1	Q96KC9	395 aa		6.6	□□□□□ -1.35

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