RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, human

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2B-208	ENST00000511807	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	WDR26	Q9H7D7	661 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807		J3QKU1	62 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	GLB1	P16278	677 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	XIAP	P98170	497 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	NAB1	Q13506	487 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TGIF1	Q15583	401 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ULK4	Q96C45	1275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TCF12	Q99081	682 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	LGR4	Q9BXB1	951 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ASB8	Q9H765	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CD84	Q9UIB8	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CCL22	O00626	93 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TNFRSF10C	O14798	259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	NOBOX	O60393	691 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	IVL	P07476	585 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	GM2A	P17900	193 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ITIH1	P19827	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ARNT	P27540	789 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TEAD1	P28347	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CCKBR	P32239	447 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	GPR1	P46091	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TTPA	P49638	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	NFATC2	Q13469	925 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PEX6	Q13608	980 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PNCK	Q6P2M8	343 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	HDX	Q7Z353	690 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	SPRED1	Q7Z699	444 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	MED8	Q96G25	268 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	VPS18	Q9P253	973 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	PRSS38	A1L453	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	C2orf72	A6NCS6	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UBE2B-208	ENST00000511807	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms