RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	RHD	Q02161	417 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	GPS1	Q13098	491 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MPP5	Q8N3R9	675 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ELMO1	Q92556	727 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ART4	Q93070	314 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf72	Q96LT7	481 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	COG4	Q9H9E3	785 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TTLL3-231	ENST00000496246	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL22	O00626	93 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	NDC80	O14777	642 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MT-ND3	P03897	115 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	APOA4	P06727	396 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CSF2RB	P32927	897 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ1	P48048	391 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FNTA	P49354	379 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS41	P49754	854 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SEPHS1	P49903	392 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ACY1	Q03154	408 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	IL11RA	Q14626	422 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	KMT5C	Q86Y97	462 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CARF	Q8N187	725 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB33B	Q9H082	229 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	SPEG	Q15772	3267 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PHF2	O75151	1096 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	C9	P02748	559 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CCL4	P13236	92 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	BRAF	P15056	766 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	GNG11	P61952	73 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	MC2R	Q01718	297 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	CLN3	Q13286	438 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	DBN1	Q16643	649 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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