RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PSPC1-204ENST00000492741 GPR78Q96P69 363 aa21.63■■□□□ 1.05
PSPC1-204ENST00000492741 ALG9Q9H6U8 611 aa21.63■■□□□ 1.05
PSPC1-204ENST00000492741 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PSPC1-204ENST00000492741 SLC23A2Q9UGH3 650 aa21.63■■□□□ 1.05
PSPC1-204ENST00000492741 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.63■■□□□ 1.05
PSPC1-204ENST00000492741 BTN3A1O00481 513 aa21.63■■□□□ 1.05
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PSPC1-204ENST00000492741 PLIN3O60664 434 aa21.63■■□□□ 1.05
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PSPC1-204ENST00000492741 XPR1Q9UBH6 696 aa21.62■■□□□ 1.05
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PSPC1-204ENST00000492741 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa21.61■■□□□ 1.05
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PSPC1-204ENST00000492741 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.6■■□□□ 1.05
PSPC1-204ENST00000492741 EXT2Q93063 718 aa21.6■■□□□ 1.05
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PSPC1-204ENST00000492741 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa21.6■■□□□ 1.05
PSPC1-204ENST00000492741 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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