RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-209ENST00000480420 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-209ENST00000480420 PDP2Q9P2J9 529 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-209ENST00000480420 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-209ENST00000480420 RARRES3Q9UL19 164 aa7.9□□□□□ -1.14
CTPS1-209ENST00000480420 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
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CTPS1-209ENST00000480420 MGAT4DA6NG13 374 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K7O43318 606 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ13O60928 360 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SPAG6O75602 509 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GAS8O95995 478 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 IFNB1P01574 187 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 C9P02748 559 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PRSS56P0CW18 603 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 FOLR1P15328 257 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CDH3P22223 829 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 FECHP22830 423 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 HADHAP40939 763 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TERF1P54274 439 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PDE1BQ01064 536 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 MC1RQ01726 317 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD18Q0P651 414 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CDC20Q12834 499 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PRKG2Q13237 762 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SNX1Q13596 522 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GPR19Q15760 415 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC38Q502W7 563 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 RANBP10Q6VN20 620 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 HOOK3Q86VS8 718 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OOSP2Q86WS3 158 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PHC3Q8NDX5 983 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 LCN9Q8WX39 176 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ULK4Q96C45 1275 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 COPS8Q99627 209 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A18Q9H1K4 315 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 UCK1Q9HA47 277 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 IRAK4Q9NWZ3 460 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CROTQ9UKG9 612 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.89□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OR5K3A6NET4 321 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP6O43182 974 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 METTL18O95568 372 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ITGB6P18564 788 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 ADRA1AP35348 466 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 STAT5AP42229 794 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PREPP48147 710 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 IL11RAQ14626 422 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 PARP6Q2NL67 630 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 METRNLQ641Q3 311 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SNX20Q7Z614 316 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 NXPE1Q8N323 547 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 TTC13Q8NBP0 860 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 OR2L2Q8NH16 312 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 UBXN4Q92575 508 aa7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CTPS1-209ENST00000480420 MR1Q95460 341 aa7.88□□□□□ -1.15
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