RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ILK	Q13418	452 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPR18	Q14330	331 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NR1D2	Q14995	579 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831		A0A0G2JNG1	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AP2A2	O94973	939 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HGF	P14210	728 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	JUP	P14923	745 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TYRP1	P17643	537 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ECHS1	P30084	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GFER	P55789	205 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCDC25	Q86WR0	208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GATA6	Q92908	595 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CERS2	Q96G23	380 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NDN	Q99608	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MAGEB16	A2A368	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	VIP	P01282	170 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR56A5	P0C7T3	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	VCL	P18206	1134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PAM	P19021	973 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23	2e-7	■■□□□ 14.3
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SSTR1	P30872	391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TTPA	P49638	278 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPX6	P59796	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SHC2	P98077	582 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	E2F1	Q01094	437 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BIRC2	Q13490	618 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SPIDR	Q14159	915 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ISX	Q2M1V0	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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