RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466274.1

NCL-208, Transcript of nucleolin, human

TSL 2

Gene NCL, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCL-208	ENST00000466274	UGT2B4	P06133	528 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	VDR	P11473	427 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	CD19	P15391	556 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	HOXD13	P35453	343 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	PBX1	P40424	430 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	STAT6	P42226	847 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	FASLG	P48023	281 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	VAV2	P52735	878 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	AMPD3	Q01432	767 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	LRRC31	Q6UY01	552 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274		Q6ZS92	163 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	NAGS	Q8N159	534 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	BCORP1	Q8N888	145 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	AVL9	Q8NBF6	648 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	UBA3	Q8TBC4	463 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	GRHL3	Q8TE85	626 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	IP6K3	Q96PC2	410 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	PSMB7	Q99436	277 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	OLAH	Q9NV23	265 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	SNX7	Q9UNH6	387 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		5.77	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	KLF4	O43474	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	CLDN14	O95500	239 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	GSR	P00390	522 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TRIM49	P0CI25	452 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TRIM49C	P0CI26	452 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	FGF5	P12034	268 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	GJB2	P29033	226 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	OR1E1	P30953	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TRIM23	P36406	574 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ACTR1B	P42025	376 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	MAPK9	P45984	424 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	RGS7	P49802	495 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	MEOX1	P50221	254 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	IST1	P53990	364 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	RAC3	P60763	192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	ACTR1A	P61163	376 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	CDK17	Q00537	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	RBPJ	Q06330	500 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	CDC16	Q13042	620 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	IL10RA	Q13651	578 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	RAPSN	Q13702	412 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	MYBPC3	Q14896	1274 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	LLGL1	Q15334	1064 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	STIL	Q15468	1287 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	RNF151	Q2KHN1	245 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	MYLK3	Q32MK0	819 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	DCAF10	Q5QP82	559 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274		Q6ZSN1	163 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	CUZD1	Q86UP6	607 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	NRROS	Q86YC3	692 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	HMCES	Q96FZ2	354 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	EPSTI1	Q96J88	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	MED15	Q96RN5	788 aa		5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
NCL-208	ENST00000466274	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		5.76	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms