RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 FGF11Q92914 225 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 USP7Q93009 1102 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PPM1MQ96MI6 270 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PWWP2AQ96N64 755 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TTC25Q96NG3 672 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM74Q96NL1 305 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 COPS8Q99627 209 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 APMAPQ9HDC9 416 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TREX1Q9NSU2 369 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PISDQ9UG56 409 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 HEATR9A2RTY3 570 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 LILRA5A6NI73 299 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5K4A6NMS3 321 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 E7EVH7 732 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CES2O00748 559 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PLD2O14939 933 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 BANF1O75531 89 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 VIPP01282 170 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TPBGLP0DKB5 382 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGB6P18564 788 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 IDSP22304 550 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A2P31639 672 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA6P43360 314 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PREPP48147 710 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 NPY2RP49146 381 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MAPK10P53779 464 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 GNG11P61952 73 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE1BQ01064 536 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CACNG1Q06432 222 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR33Q49SQ1 333 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MSS51Q4VC12 460 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PCID2Q5JVF3 399 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC14AQ86T13 490 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 VRK3Q8IV63 474 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 BMPERQ8N8U9 685 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4L1Q8NH43 312 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ULK4Q96C45 1275 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf66Q96MD2 445 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KIFC1Q9BW19 673 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 COG4Q9H9E3 785 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 GALPQ9UBC7 116 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL3Q9UH77 587 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MED13Q9UHV7 2174 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ITPR1Q14643 2758 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCAB7A8K855 629 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 TP73O15350 636 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF5CO60282 957 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAMEF10O60809 474 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ13O60928 360 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 UBXN7O94888 489 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 C9P02748 559 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 AMD1P17707 334 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ACADLP28330 430 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CCR7P32248 378 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 MAGEA3P43357 314 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 SH3BP2P78314 561 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 GPLD1P80108 840 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 CLN3Q13286 438 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 BIRC2Q13490 618 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ITIH4Q14624 930 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf22Q6V702 233 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 PACS1Q6VY07 963 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-206ENST00000461017 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.84□□□□□ -1.31
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