RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454619.5

NME4-208, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, human

TSL 5

Gene NME4, Length 719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NME4-208	ENST00000454619	APOL1	O14791	398 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	PMPCB	O75439	489 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CYP2A7	P20853	494 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	CDH3	P22223	829 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ABR	Q12979	859 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	RAPGEF5	Q92565	580 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	HACD3	Q9P035	362 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.9	□□□□□ -0.18
NME4-208	ENST00000454619	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619		C9J4A7	227 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	MAP3K7	O43318	606 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	KRT86	O43790	486 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	UGT1A9	O60656	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	KLHL41	O60662	606 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	CBX6	O95503	412 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	ALPP	P05187	535 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	CAPN1	P07384	714 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	PYGM	P11217	842 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	UGT1A6	P19224	532 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	HLA-DPA1	P20036	260 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	MSH3	P20585	1137 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	UGT1A1	P22309	533 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	UGT1A4	P22310	534 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	NDUFS1	P28331	727 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	AKT1	P31749	480 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	NCF4	Q15080	339 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	IP6K3	Q96PC2	410 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	SMOX	Q9NWM0	555 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	POMT2	Q9UKY4	750 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	MGAT4D	A6NG13	374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	GPR39	O43194	453 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	LCA5L	O95447	670 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	SERPINC1	P01008	464 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	MSL3P1	P0C860	447 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	PREP	P48147	710 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	RAPSN	Q13702	412 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	KRT33B	Q14525	404 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	NR1I3	Q14994	352 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	KYNU	Q16719	465 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NME4-208	ENST00000454619	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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