RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PATE1	Q8WXA2	126 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAFAH2	Q99487	392 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR21	Q99679	349 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBBP8	Q99708	897 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYF5	P13349	255 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	F3	P13726	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDKN2D	P55273	166 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MROH9	Q5TGP6	573 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBTB2	Q8N680	514 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	GLMN	Q92990	594 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SHBG	P04278	402 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC2A4	P14672	509 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLA2G5	P39877	138 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLCN7	P51798	805 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PGGT1B	P53609	377 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIMK2	P53671	638 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	DAB2	P98082	770 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPA4	Q13156	261 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT33B	Q14525	404 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLCA4	Q14CN2	919 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIM3	Q86V86	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	VRK3	Q8IV63	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAGS	Q8N159	534 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	KY	Q8NBH2	561 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	OLFM1	Q99784	485 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMIM23	A6NLE4	172 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRAF	P15056	766 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPIA	P49247	311 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIMK1	P53667	647 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	POU4F1	Q01851	419 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABR	Q12979	859 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARL10	Q8N8L6	244 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	INPP5D	Q92835	1189 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms