RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361198.9

LDB1-201, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LDB1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-201ENST00000361198 OR2T11Q8NH01 316 aa22.26■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 OR2T3Q8NH03 318 aa22.26■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 MPP4Q96JB8 637 aa22.26■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 ZNF382Q96SR6 550 aa22.26■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 MATN4O95460 622 aa22.25■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 CHEK2O96017 543 aa22.25■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 IDO1P14902 403 aa22.25■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.25■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 GPR33Q49SQ1 333 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 PPP4R4Q6NUP7 873 aa22.24■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 AMIGO2Q86SJ2 522 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.24■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 RGS4P49798 205 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 PTSQ03393 145 aa22.24■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.24■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 ASIC4Q96FT7 647 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 HIC2Q96JB3 615 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 BBS2Q9BXC9 721 aa22.24■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.24■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 H6PDO95479 791 aa22.23■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 STAMBPO95630 424 aa22.23■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.23■■□□□ 1.15
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LDB1-201ENST00000361198 COQ5Q5HYK3 327 aa22.22■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa22.22■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.22■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 Q6ZVU0 165 aa22.22■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.22■■□□□ 1.15
LDB1-201ENST00000361198 CHST14Q8NCH0 376 aa22.22■■□□□ 1.15
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