RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CFAP99D6REC4 459 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 WNT9AO14904 365 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PSMC3P17980 439 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GBX1Q14549 363 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 SULT1C3Q6IMI6 304 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 LETMD1Q6P1Q0 360 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 DSELQ8IZU8 1212 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.57■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 WWOXQ9NZC7 414 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CLEC1BQ9P126 229 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GIPC1O14908 333 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 INPP4BO15327 924 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 KATNA1O75449 491 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 KRT36O76013 467 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 KAT7O95251 611 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GDI1P31150 447 aa17.56■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 ADAM15Q13444 863 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PAOXQ6QHF9 649 aa17.56■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 RDH14Q9HBH5 336 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CCDC167Q9P0B6 97 aa17.56■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 LBPP18428 481 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ATP4BP51164 291 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 NME5P56597 212 aa17.55■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 NRSN1Q8IZ57 195 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 OR4F6Q8NGB9 312 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 OR9I1Q8NGQ6 314 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ELMO1Q92556 727 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.55■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 EFCAB1Q9HAE3 211 aa17.55■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa17.55■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 PDE10AQ9Y233 779 aa17.55■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 MMP20O60882 483 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 AP2A2O94973 939 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PSMG1O95456 288 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 CHEK2O96017 543 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 LAMP2P13473 410 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 GPX3P22352 226 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 RPIAP49247 311 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 C16orf89Q6UX73 402 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 HPS6Q86YV9 775 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 OR2T11Q8NH01 316 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ELSPBP1Q96BH3 223 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 DTD2Q96FN9 168 aa17.55■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 FAM8A1Q9UBU6 413 aa17.55■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 REV3LO60673 3130 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 TMEM202A6NGA9 273 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 H0Y858 1186 aa17.54■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 FBP2O00757 339 aa17.54■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 WASP42768 502 aa17.54■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 CTSCP53634 463 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ELP6Q0PNE2 266 aa17.54■□□□□ 0.4
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ACTB-201ENST00000331789 TRAF3Q13114 568 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ART3Q13508 389 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 KIF19Q2TAC6 998 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-201ENST00000331789 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
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