RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 FAM153CQ494X1 144 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC157Q569K6 752 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 XKR5Q6UX68 686 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SFRP1Q8N474 314 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 ARL14Q8N4G2 192 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK15Q8TD08 544 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SLC37A2Q8TED4 501 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 WWP1Q9H0M0 922 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 PSAT1Q9Y617 370 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD4-201ENST00000306324 UNC13CQ8NB66 2214 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 OR5K4A6NMS3 321 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 TNFRSF8P28908 595 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PHBP35232 272 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CD151P48509 253 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GUSBP11Q6P575 273 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CYS1Q717R9 158 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CTAGE3PQ8IX95 158 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 WASH6PQ9NQA3 447 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0G2JNG1 304 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 FAM159BA6NKW6 160 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 OR52A4PA6NMU1 304 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PDHA2P29803 388 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 KIR2DS5Q14953 304 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CLCA4Q14CN2 919 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT7Q86SF2 657 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GLRX5Q86SX6 157 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM159Q96B96 161 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 NDNQ99608 321 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 APOA4P06727 396 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ACP1P24666 158 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 AOAHP28039 575 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ID4P47928 161 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 VSNL1P62760 191 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RPA4Q13156 261 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 TMED2Q15363 201 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9B2Q86UD5 537 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1NQ8N819 430 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 IFI44Q8TCB0 444 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 C12orf66Q96MD2 445 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 LRIT1Q9P2V4 623 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 COMMD10Q9Y6G5 202 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.87■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SLC5A10A0PJK1 596 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 KPNA5O15131 536 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 C1QAP02745 245 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GLB1P16278 677 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ACADVLP49748 655 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PMS2P54278 862 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 HHEXQ03014 270 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GPATCH11Q8N954 259 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 OR6C4Q8NGE1 309 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 NAT6Q93015 286 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 OR52A5Q9H2C5 316 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 GALPQ9UBC7 116 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 CPNE7Q9UBL6 633 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 VIPP01282 170 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 SLC19A1P41440 591 aa21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
HOXD4-201ENST00000306324 RPE65Q16518 533 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms