RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD21Q4G0X4 260 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TSTD2Q5T7W7 516 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 REP15Q6BDI9 236 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RLN3Q8WXF3 142 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ROPN1LQ96C74 230 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NXNL1Q96CM4 212 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PHOX2BQ99453 314 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TBL1YQ9BQ87 522 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMA1P25391 3075 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCMQ8IYD8 2048 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf72A4D263 438 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 E7ENX8 843 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 J3KR12 359 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NPC1O15118 1278 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TPH1P17752 444 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SAT1P21673 171 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC12A2P55011 1212 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP107P57740 925 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATS1Q496A3 300 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf64Q5T6V5 341 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 AFMIDQ63HM1 303 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4R4Q6NUP7 873 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A9Q8IVM8 553 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 PGBD3Q8N328 593 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 MRGPRX1Q96LB2 322 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FCRL5Q96RD9 977 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM79Q9BSE2 394 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 RETREG1Q9H6L5 497 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM181Q9P2C4 612 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 EBF1Q9UH73 591 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A13Q9UJS0 675 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 HS3ST2Q9Y278 367 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-201ENST00000246533 BBIP1A8MTZ0 92 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 BNIP3LO60238 219 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNCP24863 283 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CD151P48509 253 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ADARP55265 1226 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SERINC3Q13530 473 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 GK5Q6ZS86 529 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZVU0 165 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 LPGAT1Q92604 370 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZUFSPQ96AP4 578 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM15Q9C019 465 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TNKS2Q9H2K2 1166 aa25.95■■□□□ 1.74
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH14Q0VDD8 3507 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 DFFAO00273 331 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 HRO43593 1189 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 SRP72O76094 671 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 JCHAINP01591 159 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 RBP1P09455 135 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB44Q8NCP5 570 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TNIP2Q8NFZ5 429 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 APOL2Q9BQE5 337 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0J9YVX5 310 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM64CA6NLI5 447 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 KDELR3O43731 214 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 GPC4O75487 556 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 C7P10643 843 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXA6P31267 233 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ESRRGP62508 458 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 STARD3Q14849 445 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CYTH1Q15438 398 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF528Q3MIS6 628 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 LRTOMTQ8WZ04 291 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN17Q96FV3 270 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MARK4Q96L34 752 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 AXIN1O15169 862 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 NDST2P52849 883 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 GEMP55040 296 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB15P59190 212 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 NRF1Q16656 503 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP97Q8IW35 865 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 STK40Q8N2I9 435 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD2AQ8NA29 543 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa25.93■■□□□ 1.74
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