RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	SLC1A2	P43004	574 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	SPART	Q8N0X7	666 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	HASPIN	Q8TF76	798 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	RANBP9	Q96S59	729 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MROH8	Q9H579	483 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ICMT	O60725	284 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	SH3BGRL	O75368	114 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	DIRAS1	O95057	198 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	PTPN3	P26045	913 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	GSTM2	P28161	218 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	DPP6	P42658	865 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CD47	Q08722	323 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	NOG	Q13253	232 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TUBB3	Q13509	450 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	SLC36A3	Q495N2	470 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	KCNA7	Q96RP8	456 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	OSMR	Q99650	979 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	SNX7	Q9UNH6	387 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ACOT8	O14734	319 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	DGKQ	P52824	942 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TTC23L	Q6PF05	361 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	USP43	Q70EL4	1123 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	KDM1B	Q8NB78	822 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	OR52E6	Q96RD3	313 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	IL12RB2	Q99665	862 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	PRR23A	A6NEV1	266 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624		H0YAE9	185 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TNFRSF10A	O00220	468 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MYL12B	O14950	172 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	PSKH1	P11801	424 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	INSRR	P14616	1297 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	BDNF	P23560	247 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	DNAJB2	P25686	324 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CD40LG	P29965	261 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	NOS2	P35228	1153 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TALDO1	P37837	337 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CXCR3	P49682	368 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	OXA1L	Q15070	435 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	VPS35	Q96QK1	796 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	GPR22	Q99680	433 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		12.01	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	AP2A2	O94973	939 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MT-ND2	P03891	347 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TIE1	P35590	1138 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MATK	P42679	507 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ASPA	P45381	313 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CES4A	Q5XG92	561 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	SPATC1	Q76KD6	591 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	RRM2B	Q7LG56	351 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	GPSM1	Q86YR5	675 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	SLC34A3	Q8N130	599 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	RNFT2	Q96EX2	444 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CTRC	Q99895	268 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	AASS	Q9UDR5	926 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	NFASC	O94856	1347 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	CHRNA4	P43681	627 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	C1QTNF8	P60827	252 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	LRP8	Q14114	963 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		12	□□□□□ -0.49
PXN-222	ENST00000637624	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		12	□□□□□ -0.49

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