RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623935.1

SOX9-AS1-217, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 1,563 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CD200R1Q8TD46 325 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BMFQ96LC9 184 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LGR4Q9BXB1 951 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DERL2Q9GZP9 239 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PLLPQ9Y342 182 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TRIOO75962 3097 aa8.4□□□□□ -1.06
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.4□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MGAT4DA6NG13 374 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SYCE1LA8MT33 242 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TNFRSF10CO14798 259 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CHUKO15111 745 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 THEGLP0DJG4 465 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GNSP15586 552 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TAC1P20366 129 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 AOAHP28039 575 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CD38P28907 300 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CNR2P34972 360 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BLKP51451 505 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CTSCP53634 463 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PFN3P60673 137 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IRF9Q00978 393 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IL9RQ01113 521 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 AMZ2Q86W34 360 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 HM13Q8TCT9 377 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MGARPQ8TDB4 240 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NXNL1Q96CM4 212 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LINGO1Q96FE5 620 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FOPNLQ96NB1 174 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 KLQ9UEF7 1012 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TECTAO75443 2155 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRSS38A1L453 326 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 H0Y8X5 98 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 H3BM21 787 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TNFRSF10AO00220 468 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 BTN3A1O00481 513 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TNFP01375 233 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CHN1P15882 459 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TFEBP19484 476 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 AVPR2P30518 371 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CCR7P32248 378 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GNPDA1P46926 289 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 GLRBP48167 497 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CSRP3P50461 194 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IRX4P78413 519 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 DMWDQ09019 674 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ASPHQ12797 758 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LRP8Q14114 963 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 TEAD4Q15561 434 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CEP68Q76N32 757 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CLEC14AQ86T13 490 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 IQCHQ86VS3 1027 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.39□□□□□ -1.07
SOX9-AS1-217ENST00000623935 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms