RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC78A2IDD5 438 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 K7ENP7 123 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 INPP4BO15327 924 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OIP5O43482 229 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NOBOXO60393 691 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 C1QL1O75973 258 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SLC4A1P02730 911 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PNLIPP16233 465 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 BPIP17213 487 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ITIH1P19827 911 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CA4P22748 312 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PSMA3P25788 255 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 AK4P27144 223 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ARNTP27540 789 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MAPK1P28482 360 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CCKBRP32239 447 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CETN2P41208 172 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ACTR1BP42025 376 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PDX1P52945 283 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ACTR1AP61163 376 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 XIAPP98170 497 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CDK3Q00526 305 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 GPS1Q13098 491 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MPP3Q13368 585 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PARP6Q2NL67 630 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC38Q502W7 563 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MANEAQ5SRI9 462 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SPRED1Q7Z699 444 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CLEC14AQ86T13 490 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF843Q8N446 348 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OR13C4Q8NGS5 318 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OR13J1Q8NGT2 312 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 USP7Q93009 1102 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM159Q96B96 161 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 AP2M1Q96CW1 435 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 DTD2Q96FN9 168 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 LRRC1Q9BTT6 524 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CDH19Q9H159 772 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 RDH14Q9HBH5 336 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SYBUQ9NX95 663 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 IL17CQ9P0M4 197 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ZFATQ9P243 1243 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 APPL1Q9UKG1 709 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SUFUQ9UMX1 484 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.8□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MROH6A6NGR9 719 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OR51F1A6NGY5 319 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 A6NHS1 94 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 J3QKU1 62 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PSMD11O00231 422 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NVLO15381 856 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SGTAO43765 313 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 PRAMEF10O60809 474 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ECEL1O95672 775 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CPNE6O95741 557 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 EPOP01588 193 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 C1QAP02745 245 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 FGF1P05230 155 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 APRTP07741 180 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 LIPCP11150 499 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TPSB2P20231 275 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 MGAT1P26572 445 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 STIP1P31948 543 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM23P36406 574 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 ADCY8P40145 1251 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 POLD2P49005 469 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 SPINT3P49223 89 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 GEMP55040 296 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 OR1D5P58170 312 aa5.79□□□□□ -1.48
LINC00963-215ENST00000622972 RPL26P61254 145 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms