RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592159.1

KDM4B-209, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 3

Gene KDM4B, Length 411 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-209ENST00000592159 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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KDM4B-209ENST00000592159 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.58□□□□□ -0.88
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KDM4B-209ENST00000592159 AADATQ8N5Z0 425 aa9.58□□□□□ -0.88
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KDM4B-209ENST00000592159 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.57□□□□□ -0.88
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KDM4B-209ENST00000592159 GMNCA6NCL1 334 aa9.57□□□□□ -0.88
KDM4B-209ENST00000592159 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.57□□□□□ -0.88
KDM4B-209ENST00000592159 PSMD11O00231 422 aa9.57□□□□□ -0.88
KDM4B-209ENST00000592159 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
KDM4B-209ENST00000592159 PLIN3O60664 434 aa9.57□□□□□ -0.88
KDM4B-209ENST00000592159 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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