RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 CCR3P51677 355 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 TERF2Q15554 542 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPMQ5VYY2 423 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 EDAQ92838 391 aa30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 BTN3A1O00481 513 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 GPC4O75487 556 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 VIMP08670 466 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TPBGLP0DKB5 382 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 AKT2P31751 481 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CHI3L2Q15782 390 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSBG2Q5FVE4 666 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 APOOQ9BUR5 198 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF112Q9ULX5 631 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM24O75264 130 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SLCO2B1O94956 709 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINE1P05121 402 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK9P45984 424 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJB13P59910 316 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 NFKB2Q00653 900 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXJ1Q92949 421 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 GLMNQ92990 594 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 LGR4Q9BXB1 951 aa30.5■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 DLX3O60479 287 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC24CP53992 1094 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1024LP59773 190 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPA14Q0VDF9 509 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4D1Q15615 310 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRTM4Q86VH4 590 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 OR6Y1Q8NGX8 325 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM159Q96B96 161 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1A2Q9Y585 309 aa30.49■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 DCNP07585 359 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 YPEL5P62699 121 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TSNQ15631 228 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM31Q5JXX7 168 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CYHR1Q6ZMK1 362 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM174AQ8TBP5 190 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TPSD1Q9BZJ3 242 aa30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC5A10A0PJK1 596 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC7O00311 574 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 IPO13O94829 963 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM107AO95990 144 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 KELP23276 732 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 STX3Q13277 289 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SYTL3Q4VX76 610 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC34Q8IZ02 419 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR174Q9BXC1 333 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CDYLQ9Y232 598 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa30.47■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 KMOO15229 486 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-34P06331 123 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 C8GP07360 202 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNC1P48547 511 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 NAA20P61599 178 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 BST1Q10588 318 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 CPLX4Q7Z7G2 160 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF547Q8IVP9 402 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SPNS2Q8IVW8 549 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2L2Q8NH16 312 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 HM13Q8TCT9 377 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 GRAMD1AQ96CP6 724 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 PITPNM3Q9BZ71 974 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 FZD3Q9NPG1 666 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 THAP1Q9NVV9 213 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa30.46■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 MGAT4DA6NG13 374 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MT66 165 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM114B3SHH9 223 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A5O15375 505 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 EDF1O60869 148 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA6P31267 233 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB5P36952 375 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 SP140Q13342 867 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TJAP1Q5JTD0 557 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 GPSM1Q86YR5 675 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 OXR1Q8N573 874 aa30.45■■■□□ 2.47
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM145Q8NBT3 493 aa30.45■■■□□ 2.47
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