RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784		A8MU76	341 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	STMND1	H3BQB6	276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCL22	O00626	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GAS8	O95995	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	AMD1	P17707	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ACRV1	P26436	265 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ARSD	P51689	593 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GFER	P55789	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MC2R	Q01718	297 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RHD	Q02161	417 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CACNG1	Q06432	222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SNX1	Q13596	522 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SEPT6	Q14141	434 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PMEPA1	Q969W9	287 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ATM	Q13315	3056 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	HEATR9	A2RTY3	570 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784		E7EVH7	732 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TK2	O00142	265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FGG	P02679	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ETS1	P14921	441 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TYRP1	P17643	537 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	LMAN1	P49257	510 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TGIF1	Q15583	401 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	XKR5	Q6UX68	686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GPR150	Q8NGU9	434 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GSTM1	P09488	218 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GSTM4	Q03013	218 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	NAT14	Q8WUY8	206 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	PEX13	Q92968	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	C12orf66	Q96MD2	445 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	WWP1	Q9H0M0	922 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CASS4	Q9NQ75	786 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	QSOX1	O00391	747 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	EFS	O43281	561 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	CEP104	O60308	925 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKD1-231	ENST00000566784	AP2A2	O94973	939 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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