RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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PTPRB-209ENST00000550857 RPS24P62847 133 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
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PTPRB-209ENST00000550857 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-209ENST00000550857 FAM189A2Q15884 450 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRB-209ENST00000550857 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.94□□□□□ -1.14
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