RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 MAB21L1Q13394 359 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 GK3PQ14409 553 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 DLG2Q15700 870 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 DCAF6Q58WW2 860 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 UBXN11Q5T124 520 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 HERC6Q8IVU3 1022 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 TEKT5Q96M29 485 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 CPNE1Q99829 537 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 MED28Q9H204 178 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 COMMD9Q9P000 198 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 SULT1E1P49888 294 aa5.99□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 CYB561D2O14569 222 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 BANF1O75531 89 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 SUPT7LO94864 414 aa5.98□□□□□ -1.45
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PTPRD-214ENST00000540109 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRD-214ENST00000540109 RABL3Q5HYI8 236 aa5.98□□□□□ -1.45
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