RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526539.2

SLC38A6-209, Transcript of solute carrier family 38 member 6, humanhuman

TSL 4

Gene SLC38A6, Length 755 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6-209ENST00000526539 SNX24Q9Y343 169 aa7.17□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa7.17□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.17□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CEP290O15078 2479 aa7.17□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 E7ESA3 106 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 KCNK1O00180 336 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PFDN6O15212 129 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 FGF1P05230 155 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LPLP06858 475 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 DLDP09622 509 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 GJA1P17302 382 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 FCARP24071 287 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 SERPINA4P29622 427 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 STX2P32856 288 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TNFRSF4P43489 277 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 NTHL1P78549 312 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ZXDBP98169 803 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 MGAT5Q09328 741 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 HTR4Q13639 388 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 STAT4Q14765 748 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 RASA2Q15283 850 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LLGL1Q15334 1064 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LY6G5CQ5SRR4 150 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 DENND2CQ68D51 928 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CFAP52Q8N1V2 620 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ING5Q8WYH8 240 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CPT1BQ92523 772 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ARL8AQ96BM9 186 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 MIEF2Q96C03 454 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ZNF503Q96F45 646 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 FEM1CQ96JP0 617 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 AGAP3Q96P47 875 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PNKPQ96T60 521 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ENKD1Q9H0I2 346 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CDH19Q9H159 772 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 DPH5Q9H2P9 285 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 BRD9Q9H8M2 597 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 SUN2Q9UH99 717 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 VPS51Q9UID3 782 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 NFU1Q9UMS0 254 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 INSIG1O15503 277 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LINC01565O15544 149 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 MBTPS2O43462 519 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 SH3BP5O60239 455 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TSPAN3O60637 253 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PEX14O75381 377 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TCEA3O75764 348 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ZMPSTE24O75844 475 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PEX11BO96011 259 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 APODP05090 189 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 POLBP06746 335 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 NUDT17P0C025 328 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 DRD1P21728 446 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CSKP41240 450 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 MAGEA3P43357 314 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 PMS2P54278 862 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LGALS4P56470 323 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 RHOAP61586 193 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 ITKQ08881 620 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LMAN2Q12907 356 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 LGSNQ5TDP6 509 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 KCTD11Q693B1 232 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 VITQ6UXI7 678 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TMEM25Q86YD3 366 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 CDKL2Q92772 493 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC38A6-209ENST00000526539 TADA1Q96BN2 335 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms