RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	LSS	P48449	732 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TTPA	P49638	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PRLHR	P49683	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ARSD	P51689	593 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PDX1	P52945	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TERF1	P54274	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CRADD	P78560	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GSTM4	Q03013	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ACVR1	Q04771	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ITIH4	Q14624	930 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	DBN1	Q16643	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PHF19	Q5T6S3	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM159	Q96B96	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CCDC188	H7C350	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PLD2	O14939	933 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PFDN6	O15212	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	SGTA	O43765	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TMEM63A	O94886	807 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	UBXN7	O94888	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	AP2A2	O94973	939 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	TNFSF15	O95150	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	FTH1	P02794	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	POLB	P06746	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	JMJD7	P0C870	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG4-205	ENST00000507692	THRA	P10827	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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