RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499666.6

LAMTOR3-202, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMTOR3, Length 4,226 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3-202ENST00000499666 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 CCL26Q9Y258 94 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ANKRD12Q6UB98 2062 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 SAC3D1A6NKF1 404 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 H0Y858 1186 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 KIAA0355O15063 1070 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 CLDN9O95484 217 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ZNF30P17039 623 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 GNPDA1P46926 289 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ARF5P84085 180 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 TMEM240Q5SV17 173 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 LDLRAP1Q5SW96 308 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 HTR3DQ70Z44 454 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 KRT78Q8N1N4 520 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 RNF145Q96MT1 663 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 CCDC3Q9BQI4 270 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 INVSQ9Y283 1065 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 LINC01553A4QN01 128 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 GPR39O43194 453 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 LDB2O43679 373 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ATP6V1B2P21281 511 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 RFX3P48380 749 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 CYP4F2P78329 520 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 TGFBIQ15582 683 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 CD300LGQ6UXG3 332 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 GCNT7Q6ZNI0 430 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 MTSS1LQ765P7 747 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 HORMAD1Q86X24 394 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 DSELQ8IZU8 1212 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 PGBD5Q8N414 524 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 KIAA1191Q96A73 305 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 MYRFLQ96LU7 910 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 RTKNQ9BST9 563 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 LRTM1Q9HBL6 345 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 SGK2Q9HBY8 427 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 DZANK1Q9NVP4 752 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 SBF1O95248 1867 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ZNF839A8K0R7 811 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 K7EPI3 171 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 AGRPO00253 132 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 NDUFS2O75306 463 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 KCNH1O95259 989 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 HLA-FP30511 346 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 AGTR2P50052 363 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 POLE2P56282 527 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 SLC7A9P82251 487 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 VAC14Q08AM6 782 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 RALGDSQ12967 914 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 PTPRRQ15256 657 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ZNF805Q5CZA5 627 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 KCTD11Q693B1 232 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 GPR180Q86V85 440 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 TCAIMQ8N3R3 496 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 RIN3Q8TB24 985 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ITFG1Q8TB96 612 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 SIPA1Q96FS4 1042 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 CNBD2Q96M20 576 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 PPM1MQ96MI6 270 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 OR52E6Q96RD3 313 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 KCNA7Q96RP8 456 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 DERL2Q9GZP9 239 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 ADNPQ9H2P0 1102 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 RFXAPO00287 272 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 TRIM24O15164 1050 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 IGLV3-25P01717 112 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMTOR3-202ENST00000499666 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms