RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 E7EQ34 232 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CCL21O00585 134 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CHUKO15111 745 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 KCNN4O15554 427 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FZD6O60353 706 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CDK14O94921 469 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SPTBP11277 2137 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DRD2P14416 443 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 BRAFP15056 766 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CES1P23141 567 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CA5AP35218 305 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RORAP35398 523 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SOX5P35711 763 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PREPP48147 710 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 KCNK10P57789 538 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RBPJQ06330 500 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PTP4A2Q12974 167 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ABRQ12979 859 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 XRCC4Q13426 336 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TLR1Q15399 786 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ASIC2Q16515 512 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CA9Q16790 459 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 XKRXQ6PP77 449 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TMEM207Q6UWW9 146 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GFRALQ6UXV0 394 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CEP97Q8IW35 865 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MMP21Q8N119 569 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GLYATL1Q969I3 302 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RELTQ969Z4 430 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CCDC120Q96HB5 630 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AGAP4Q96P64 663 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SMIM14Q96QK8 99 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 LYSMD1Q96S90 227 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PCDH9Q9HC56 1237 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PCMTD2Q9NV79 361 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 P4HTMQ9NXG6 502 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 BTRCQ9Y297 605 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ADGRG1Q9Y653 693 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FBN3Q75N90 2809 aa6□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 OR6C74A6NCV1 312 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MATN2O00339 956 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 FANCGO15287 622 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MAFKO60675 156 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 KCNJ13O60928 360 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MTX2O75431 263 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 LCA5LO95447 670 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PEX11BO96011 259 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CAPN1P07384 714 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 UQCRHP07919 91 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TPM2P07951 284 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 CHRNB2P17787 502 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 IL4RP24394 825 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 HCAR3P49019 387 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SMSP52788 366 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SOX8P57073 446 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DCDC1P59894 354 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DSC2Q02487 901 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 DPYSQ14117 519 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 KRT33BQ14525 404 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 31.4
CBX1-205ENST00000495350 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PDPK2PQ6A1A2 396 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 MON1BQ7L1V2 547 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 HOOK3Q86VS8 718 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 AMZ2Q86W34 360 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 TRAM1L1Q8N609 369 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 GPR150Q8NGU9 434 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 PTERQ96BW5 349 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZNF653Q96CK0 615 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 VPS50Q96JG6 964 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 WDR24Q96S15 920 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1-205ENST00000495350 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms