RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNDC8Q8TC99 324 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOX2Q96NM4 488 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C17orf80Q9BSJ5 609 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNIP2Q9P278 1114 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB26Q9ULW5 256 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLIC3O95833 236 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTHFD2P13995 350 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYLK3Q32MK0 819 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BIRC8Q96P09 236 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.32■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LEFTY2O00292 366 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM16O95361 564 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFAIP8O95379 198 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAG3P18627 525 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLA-FP30511 346 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL5P46777 297 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHDQ02161 417 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C5orf22Q49AR2 442 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DET1Q7L5Y6 550 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FIBCD1Q8N539 461 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OBSL1O75147 1896 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NME4O00746 187 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ECI2O75521 394 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMED10P49755 219 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBBP7Q16576 425 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RABL3Q5HYI8 236 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBCELQ5QJ74 424 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALG14Q96F25 216 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINGO1Q96FE5 620 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP22Q9UPT9 525 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR51B4Q9Y5P0 310 aa15.31■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 E5RI56 91 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BSA7 217 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPCAMP16422 314 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEX37Q96LM6 180 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCT7Q99832 543 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOCS2O14508 198 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KATNA1O75449 491 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPX3P22352 226 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTNNB1P35222 781 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMC8Q8IU68 726 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHST14Q8NCH0 376 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBP1Q9H171 429 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP10Q9P2G4 905 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLG2Q9UHN1 485 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRAMEF1O95521 474 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC5A2P31639 672 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNF1BP35680 557 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDF5P43026 501 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCQ05315 142 aa15.3■□□□□ 0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MESP2Q0VG99 397 aa15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms