RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TDRPQ86YL5 185 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB2Q8N680 514 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 LMX1AQ8TE12 382 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 P2RY12Q9H244 342 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 CENPHQ9H3R5 247 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GPAMQ9HCL2 828 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 FGF22Q9HCT0 170 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 GPR27Q9NS67 375 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 KLC4Q9NSK0 619 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.59□□□□□ -0.87
CTPS1-210ENST00000486889 EML5Q05BV3 1969 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0G2JNG1 304 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM23A6NLE4 172 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF839A8K0R7 811 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TPP1O14773 563 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ATP8B1O43520 1251 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 OR1I1O60431 355 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF883P0CG24 379 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ENGP17813 658 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CCNFP41002 786 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ID4P47928 161 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CCT5P48643 541 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 RAB10P61026 200 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 DMPKQ09013 629 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SEMA3AQ14563 771 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CASP8Q14790 479 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 KIR2DS5Q14953 304 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-BQ31612 363 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 MROH9Q5TGP6 573 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CNSTQ6PJW8 725 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 UNC5BQ8IZJ1 945 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ACMSDQ8TDX5 336 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 GPR22Q99680 433 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 BOCQ9BWV1 1114 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CAPN10Q9HC96 672 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 WDR70Q9NW82 654 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 POLG2Q9UHN1 485 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ACOT9Q9Y305 439 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 DHRS7Q9Y394 339 aa9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1B0GTQ1 180 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LMO7DNF2Z398 122 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SCAMP1O15126 338 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 GPR39O43194 453 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB14O43829 449 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SNX2O60749 519 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CATP04040 527 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 WNT1P04628 370 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 COL6A2P12110 1019 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CYP2A7P20853 494 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SDHBP21912 280 aa9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ATP6V0D1P61421 351 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms