RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 ACADVLP49748 655 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 TRADDQ15628 312 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 METRNLQ641Q3 311 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 GALNT7Q86SF2 657 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 NAGSQ8N159 534 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SFRP1Q8N474 314 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 LPGAT1Q92604 370 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 P2RY12Q9H244 342 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.17■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 A6NCN8 305 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC1A2P43004 574 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 MAGEA4P43358 317 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 FASLGP48023 281 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SYTL3Q4VX76 610 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 TEX35Q5T0J7 233 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 IYDQ6PHW0 289 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 CDKL2Q92772 493 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 ZFATQ9P243 1243 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.16■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 TRIM16O95361 564 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 ERVK-10P10266 1014 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 E2F1Q01094 437 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 MGAT5Q09328 741 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 NFE2L1Q14494 772 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 TMED2Q15363 201 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 PPM1JQ5JR12 505 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 CYS1Q717R9 158 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 RELL1Q8IUW5 271 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 WDR48Q8TAF3 677 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 IFI44Q8TCB0 444 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 ELMO1Q92556 727 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 COG4Q9H9E3 785 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 PRDM8Q9NQV8 689 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 U3KQA8 63 aa22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ARPC1B-218ENST00000484375 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CPED1A4D0V7 1026 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 S1PR4O95977 384 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 FTH1P19P0C7X4 201 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 KCNA4P22459 653 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 DNAJC3Q13217 504 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CTBP1Q13363 440 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ARL14Q8N4G2 192 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TMEM159Q96B96 161 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 POT1Q9NUX5 634 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 MOCS1Q9NZB8 636 aa22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 GIPC1O14908 333 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 APOA4P06727 396 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 STX2P32856 288 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 GPR3P46089 330 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 HHEXQ03014 270 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SLMAPQ14BN4 828 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 GUSBP11Q6P575 273 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 BIRC8Q96P09 236 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ARPC1B-218ENST00000484375 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms