RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483859.6

SENP6-208, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PPE2 198 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PR64 198 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CTAGE9A4FU28 777 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 URADA6NGE7 173 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CLGNO14967 610 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TO15178 435 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF432O94892 652 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 C22orf31O95567 290 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CTAGE8P0CG41 777 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 NR1D1P20393 614 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PEX5P50542 639 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ART1P52961 327 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TRAF2Q12933 501 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GTF2H2Q13888 395 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF234Q14588 700 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 MELKQ14680 651 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SLC39A14Q15043 492 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 FAM171BQ6P995 826 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CTAGE4Q8IX94 777 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF843Q8N446 348 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CCDC191Q8NCU4 936 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 Q8NFD4 153 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 OLIG1Q8TAK6 271 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PHF21AQ96BD5 680 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PTERQ96BW5 349 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 DACH2Q96NX9 599 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 IL17FQ96PD4 163 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 MEIS3Q99687 375 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SYT17Q9BSW7 474 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SPATC1LQ9H0A9 340 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TBC1D17Q9HA65 648 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 EBF2Q9HAK2 575 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 VDAC3Q9Y277 283 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 A0A1W2PPM1 405 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PLSCR5A0PG75 271 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ASPDHA6ND91 283 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 A6NL46 340 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SLC16A5O15375 505 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 NDUFS4O43181 175 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNHIT1O43257 154 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 DIAPH2O60879 1101 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SOCS5O75159 536 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 KRT19P08727 400 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 FAM106CPP0CH98 169 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ACP2P11117 423 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 MC5RP33032 325 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 AMPHP49418 695 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF132P52740 706 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 KRT33BQ14525 404 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 RASA2Q15283 850 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 KIF19Q2TAC6 998 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 FIGLAQ6QHK4 219 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 AVL9Q8NBF6 648 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 SEMA4DQ92854 862 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 LINGO1Q96FE5 620 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 FAM129AQ9BZQ8 928 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 PELI2Q9HAT8 420 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 OLAHQ9NV23 265 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GDE1Q9NZC3 331 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.12□□□□□ -1.91
SENP6-208ENST00000483859 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms