RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477347.1

RPSAP55-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 55, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP55, Length 876 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP55-201ENST00000477347 PLLPQ9Y342 182 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 DHRS7Q9Y394 339 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.64□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NEMP2A6NFY4 417 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 QSOX1O00391 747 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 TM9SF1O15321 606 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 GRID2O43424 1007 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 RASGRP1O95267 797 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 GSTA1P08263 222 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 THEGLP0DJG4 465 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 C7P10643 843 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 MYL2P10916 166 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 BGNP21810 368 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 KCNA4P22459 653 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 DGKAP23743 735 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 TEAD1P28347 426 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 BDKRB1P46663 353 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 SERPINB4P48594 390 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 CSRP3P50461 194 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 KIAA1024LP59773 190 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 IL9RQ01113 521 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ABRQ12979 859 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NFE2L1Q14494 772 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 OR4D1Q15615 310 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 BCL7AQ4VC05 210 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 Q6ZSR6 202 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NLRP8Q86W28 1048 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 HID1Q8IV36 788 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ASB12Q8WXK4 309 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 TMEM159Q96B96 161 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 BMFQ96LC9 184 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 COG4Q9H9E3 785 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 RNF112Q9ULX5 631 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 SUFUQ9UMX1 484 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 THADAQ6YHU6 1953 aa9.63□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 A0A1W2PPC4 97 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 PRSS38A1L453 326 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 KRT87PA6NCN2 255 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 METTL12A8MUP2 240 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 UBXN8O00124 270 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NUAK1O60285 661 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 SNX2O60749 519 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 LILRB5O75023 590 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 COL6A2P12110 1019 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 AOAHP28039 575 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 HTR1BP28222 390 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ALDH3A1P30838 453 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 RABIFP47224 123 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 PCLAFQ15004 111 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 CHI3L2Q15782 390 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 CCDC153Q494R4 210 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 CEP68Q76N32 757 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 FBXL6Q8N531 539 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 TMEM145Q8NBT3 493 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 HM13Q8TCT9 377 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 GPR78Q96P69 363 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 OR2M4Q96R27 311 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 DERL2Q9GZP9 239 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 FAM107BQ9H098 131 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 KLC4Q9NSK0 619 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 MID2Q9UJV3 735 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 DMTF1Q9Y222 760 aa9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 LRP4O75096 1905 aa9.61□□□□□ -0.87
RPSAP55-201ENST00000477347 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms