RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 FAM187AA6NFU0 413 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 LILRA5A6NI73 299 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 DUX1O43812 170 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TMEM135Q86UB9 458 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 LRRC6Q86X45 466 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PDIK1LQ8N165 341 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TCF12Q99081 682 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CDC23Q9UJX2 597 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.09■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 AKAP13Q12802 2813 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 USP1O94782 785 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TTC4O95801 387 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 POLBP06746 335 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ARNTP27540 789 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CD1CP29017 333 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CCKBRP32239 447 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 SLC19A1P41440 591 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 PDX1P52945 283 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 INHBCP55103 352 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CLCA4Q14CN2 919 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RTP5Q14D33 572 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 RPE65Q16518 533 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 CES3Q6UWW8 571 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 GPR150Q8NGU9 434 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 NAT14Q8WUY8 206 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ZMYND15Q9H091 742 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 COG4Q9H9E3 785 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 DKK4Q9UBT3 224 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.08■□□□□ 0.81
NOM1-203ENST00000469271 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 OR1I1O60431 355 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 NDUFS3O75489 264 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 PROS1P07225 676 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 C1QTNF9P0C862 333 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 PGAM1P18669 254 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 TUBB2AQ13885 445 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 TMEM159Q96B96 161 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 WWP1Q9H0M0 922 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.07■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 NDUFS1P28331 727 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 CD151P48509 253 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 SEMA3AQ14563 771 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 NEPROQ6NW34 567 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 USP53Q70EK8 1073 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 LSMEM2Q8N112 164 aa20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NOM1-203ENST00000469271 CALML6Q8TD86 181 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms