RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NRAC	Q8N912	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RIT2	Q99578	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983		Q9H521	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TXNDC9	O14530	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC16A4	O15374	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BIRC5	O15392	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PFDN1	O60925	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	LYPLA2	O95372	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NDUFB10	O96000	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CALCA	P01258	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	IFNB1	P01574	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CALB1	P05937	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CPA3	P15088	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	VCL	P18206	1134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	AOC1	P19801	751 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	EPHA3	P29320	983 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PEX3	P56589	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CFHR1	Q03591	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BST1	Q10588	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MLC1	Q15049	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SEC23B	Q15437	767 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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