RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 BROXQ5VW32 411 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 PIANPQ8IYJ0 282 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35F6Q8N357 371 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 RANBP9Q96S59 729 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 KLHL3Q9UH77 587 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 ACSL5Q9ULC5 683 aa23.49■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa23.48■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 TSTD2Q5T7W7 516 aa23.48■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM164Q5U3C3 297 aa23.48■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP206Q8IYR0 622 aa23.48■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 MS4A14Q96JA4 679 aa23.48■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 POLBP06746 335 aa23.47■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 DBN1Q16643 649 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 FAM129CQ86XR2 697 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 GPR150Q8NGU9 434 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 HM13Q8TCT9 377 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 HDAC10Q969S8 669 aa23.47■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.47■■□□□ 1.35
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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SMKR1-201ENST00000462322 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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SMKR1-201ENST00000462322 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.45■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 RSC1A1Q92681 617 aa23.45■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 ART4Q93070 314 aa23.45■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF778Q96MU6 729 aa23.45■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 TGM7Q96PF1 710 aa23.45■■□□□ 1.34
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SMKR1-201ENST00000462322 CAPZBP47756 277 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 VPS41P49754 854 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 CXADRP78310 365 aa23.44■■□□□ 1.34
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SMKR1-201ENST00000462322 PLCL1Q15111 1095 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 PCID2Q5JVF3 399 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 TTC27Q6P3X3 843 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 XKR5Q6UX68 686 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 ZFAND4Q86XD8 727 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 COG1Q8WTW3 980 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SMKR1-201ENST00000462322 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.44■■□□□ 1.34
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