RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461157.1

TAF1-206, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 1, human

TSL 3

Gene TAF1, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1-206	ENST00000461157	HMGCL	P35914	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	HADHA	P40939	763 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	P2RY2	P41231	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	WAS	P42768	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PTGER3	P43115	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	NPY2R	P49146	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	LMAN1	P49257	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	NUMB	P49757	651 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	TPMT	P51580	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ITGA8	P53708	1063 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ADPRH	P54922	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ARL4C	P56559	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	DCDC1	P59894	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SHC2	P98077	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ACVR1	Q04771	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FAP	Q12884	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	IHH	Q14623	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CDKN3	Q16667	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FMO2	Q99518	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	OMD	Q99983	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	RAD18	Q9NS91	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SPINT1	O43278	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	LAT	O43561	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	SPAG6	O75602	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	USP1	O94782	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	RHOBTB1	O94844	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CRTAM	O95727	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	AGT	P01019	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	GSTA2	P09210	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	CKMT1A	P12532	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PGAM1	P18669	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-206	ENST00000461157	PAM	P19021	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms