RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 PARVGQ9HBI0 331 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXO8Q9NRD0 319 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 INTS13Q9NVM9 706 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 C5AR2Q9P296 337 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NTNG1Q9Y2I2 539 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MPDZO75970 2070 aa4.02□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DYSFO75923 2080 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ISM1B1AKI9 464 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 B4DGG1 531 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 C21orf140B9A014 251 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 HHLA1C9JL84 531 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 F5H423 210 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CCER2I3L3R5 266 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 E2F3O00716 465 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
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ECHDC1-211ENST00000460558 ALPPP05187 535 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC130P13994 396 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CPA1P15085 419 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CD1CP29017 333 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC11A2P49281 568 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ARFIP2P53365 341 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 EVCP57679 992 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAM8P78325 824 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 GTF2BQ00403 316 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 BTKQ06187 659 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MTM1Q13496 603 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NR1D2Q14995 579 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 STK32CQ86UX6 486 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM90A1Q86YD7 464 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 APCDD1Q8J025 514 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ASB12Q8WXK4 309 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TM9SF4Q92544 642 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 WASF1Q92558 559 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM168AQ92567 244 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SAAL1Q96ER3 474 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP1R16AQ96I34 528 aa4.01□□□□□ -1.77
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ECHDC1-211ENST00000460558 CLPTM1LQ96KA5 538 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC114Q96M63 670 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 NT5C1BQ96P26 610 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TBCBQ99426 244 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 EPB41L4BQ9H329 900 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ACTL8Q9H568 366 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 APMAPQ9HDC9 416 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FGF21Q9NSA1 209 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM49BQ9NUQ9 324 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.01□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP69A5D8W1 941 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 IGLON5A6NGN9 336 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 A6NL46 340 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 C19orf84I3L1E1 186 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MASP2O00187 686 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CCL21O00585 134 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF185O15231 689 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CLIC2O15247 247 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KLHL41O60662 606 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDN14O95500 239 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 TNFP01375 233 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MT-ND3P03897 115 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CTSLP07711 333 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ADRB3P13945 408 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 AGAP20933 346 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 MALP21145 153 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 ADORA2BP29275 332 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CHRNA3P32297 505 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 CSF2RBP32927 897 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 DDIT3P35638 169 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 PBX1P40424 430 aa4□□□□□ -1.77
ECHDC1-211ENST00000460558 KIR2DL3P43628 341 aa4□□□□□ -1.77
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