RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SPC25Q9HBM1 224 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MPP6Q9NZW5 540 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.75□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 FAM92AA1XBS5 289 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 GMNNO75496 209 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MMP2P08253 660 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MTPNP58546 118 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 INAQ16352 499 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 FAM171BQ6P995 826 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SERINC5Q86VE9 423 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NAT16Q8N8M0 369 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 GPR150Q8NGU9 434 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PPM1MQ96MI6 270 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NOBOXO60393 691 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SERPINB10P48595 397 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 IST1P53990 364 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ISL1P61371 349 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 TSPY1Q01534 308 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 DSC2Q02487 901 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ACVR1Q04771 509 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 DNASE1L3Q13609 305 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 KCNJ8Q15842 424 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PHKG1Q16816 387 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 DGUOKQ16854 277 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 INAVAQ3KP66 663 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 M0R3G1 203 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 AXIN1O15169 862 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ECI2O75521 394 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 BMP4P12644 408 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SEMA3AQ14563 771 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 BEND5Q7L4P6 421 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 FAR1Q8WVX9 515 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC115Q96NT0 180 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CGREF1Q99674 301 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 DERL2Q9GZP9 239 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 RMND5AQ9H871 391 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF225Q9UK10 706 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 E9PAM4 449 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PTGES3LE9PB15 166 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ARNTLO00327 626 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NADKO95544 446 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MLYCDO95822 493 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CST1P01037 141 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC159P0C7I6 412 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CRHR2Q13324 411 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 IHHQ14623 411 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ACOX1Q15067 660 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 PGS1Q32NB8 556 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 GORASP2Q9H8Y8 452 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NOD1Q9Y239 953 aa14.73□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 STX16O14662 325 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MARC1Q5VT66 337 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF691Q5VV52 312 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 IFNL1Q8IU54 200 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 NDNFQ8TB73 568 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 TRIB2Q92519 343 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF566Q969W8 418 aa14.72□□□□□ -0.05
TOP3B-206ENST00000436282 ACOX2Q99424 681 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms