RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431663.1

GTF2IP20-201, Transcript of general transcription factor IIi pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene GTF2IP20, Length 360 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP20-201ENST00000431663 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CAVIN2O95810 425 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 FTCDO95954 541 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 EGFP01133 1207 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 RB1P06400 928 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CCDC175P0C221 793 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 MYBL1P10243 752 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 AMPHP49418 695 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ZNF131P52739 623 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CDH8P55286 799 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 KRTAP10-12P60413 245 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 OLR1P78380 273 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 GRIK2Q13002 908 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 USP41Q3LFD5 358 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ZNF876PQ49A33 203 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 C14orf177Q52M58 125 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CDC73Q6P1J9 531 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 FAM171BQ6P995 826 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 BTN2A1Q7KYR7 527 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CHST9Q7L1S5 443 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CHST3Q7LGC8 479 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 GSTA5Q7RTV2 222 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 GPR180Q86V85 440 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 METTL23Q86XA0 190 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 APPL2Q8NEU8 664 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 THAP6Q8TBB0 222 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 VPS33AQ96AX1 596 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 RMDN1Q96DB5 314 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 LGALS12Q96DT0 336 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 SPAG5Q96R06 1193 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 FNBP1Q96RU3 617 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 DESI2Q9BSY9 194 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 KLHL4Q9C0H6 718 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 DNAI2Q9GZS0 605 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 KNSTRNQ9Y448 316 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.05□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 A0A1W2PPE2 198 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 A0A1W2PR64 198 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 GLOD5A6NK44 160 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 A8MXE2 369 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 PI4K2BG5E9Z4 385 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CTDSP2O14595 271 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ADAM20O43506 726 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 SYNGR3O43761 229 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 TBX10O75333 385 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 FAM106CPP0CH98 169 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 RARGP13631 454 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ZNF23P17027 643 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CDAP32320 146 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 KIF5BP33176 963 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 PBX3P40426 434 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 NRIP1P48552 1158 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 TAF6P49848 677 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 LIG4P49917 911 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 GSTA3Q16772 222 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 MYLK3Q32MK0 819 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 RAB41Q5JT25 222 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 CCDC158Q5M9N0 1113 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 ERMARDQ5T6L9 678 aa3.04□□□□□ -1.92
GTF2IP20-201ENST00000431663 LCE1FQ5T754 118 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms