RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 TMCO1Q9UM00 188 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 HGFP14210 728 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF30P17039 623 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 DPP6P42658 865 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 MTTPP55157 894 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 PKNOX1P55347 436 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GAB4Q2WGN9 574 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 ICE2Q659A1 982 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 OARD1Q9Y530 152 aa22.83■■□□□ 1.25
FAAP20-209ENST00000428120 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 C9JVG2 144 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 RFXAPO00287 272 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 TAPBPO15533 448 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA14Q0VDF9 509 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ULK4Q96C45 1275 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD5Q9NXV2 234 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ANTXRLA6NF34 631 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 KATNA1O75449 491 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 NFATC1O95644 943 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ASLP04424 464 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 UROSP10746 265 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 STX1BP61266 288 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 RALGDSQ12967 914 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PDPRQ8NCN5 879 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 HBEGFQ99075 208 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 DEC1Q9P2X7 70 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.82■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN11A1L157 253 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FBP2O00757 339 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 OR56A5P0C7T3 313 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 GTF2H2Q13888 395 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 CCNIQ14094 377 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.242e-9■■■■■ 45
FAAP20-209ENST00000428120 MMEL1Q495T6 779 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF382Q96SR6 550 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 OR7A17O14581 309 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 VCLP18206 1134 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 THOP1P52888 689 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 KCNC3Q14003 757 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PYDC1Q8WXC3 89 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 WWOXQ9NZC7 414 aa22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 CHEK2O96017 543 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 LBPP18428 481 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 GPX3P22352 226 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SLC34A1Q06495 639 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 REP15Q6BDI9 236 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 VRK3Q8IV63 474 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 OR2T11Q8NH01 316 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 NRG4Q8WWG1 115 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 STOML1Q9UBI4 398 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN1P07384 714 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 DIO3P55073 304 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 NAA20P61599 178 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 IPPKQ9H8X2 491 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 HPS4Q9NQG7 708 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 SUN2Q9UH99 717 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.8■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 OR2AG2A6NM03 316 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 PLK4O00444 970 aa22.79■■□□□ 1.24
FAAP20-209ENST00000428120 ELFN1P0C7U0 828 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms