RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 CCT5P48643 541 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-215ENST00000427487 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-215ENST00000427487 HK3P52790 923 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-215ENST00000427487 C21orf59P57076 290 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-215ENST00000427487 IL2P60568 153 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-215ENST00000427487 ATP6V0D1P61421 351 aa11.85□□□□□ -0.51
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HDLBP-215ENST00000427487 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
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HDLBP-215ENST00000427487 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 27.9
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HDLBP-215ENST00000427487 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HDLBP-215ENST00000427487 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.84□□□□□ -0.51
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HDLBP-215ENST00000427487 SLC16A5O15375 505 aa11.83□□□□□ -0.52
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HDLBP-215ENST00000427487 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 64.5
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HDLBP-215ENST00000427487 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
HDLBP-215ENST00000427487 RASGRP3Q8IV61 690 aa11.83□□□□□ -0.52
HDLBP-215ENST00000427487 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.83□□□□□ -0.52
HDLBP-215ENST00000427487 BANPQ8N9N5 519 aa11.83□□□□□ -0.52
HDLBP-215ENST00000427487 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
HDLBP-215ENST00000427487 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.83□□□□□ -0.52
HDLBP-215ENST00000427487 PDXPQ96GD0 296 aa11.83□□□□□ -0.52
HDLBP-215ENST00000427487 APOPT1Q96IL0 206 aa11.83□□□□□ -0.52
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