RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 DMTF1Q9Y222 760 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 OARD1Q9Y530 152 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.46□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PQU0 124 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MGAT4DA6NG13 374 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GFYI3L273 518 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 BTN3A1O00481 513 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CHUKO15111 745 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 KMOO15229 486 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJC6O75061 913 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 DCTN3O75935 186 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 APBB3O95704 486 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 HSPA4LO95757 839 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MLYCDO95822 493 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SOD1P00441 154 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FGF4P08620 206 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 COL9A1P20849 921 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CYP2A7P20853 494 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CCR7P32248 378 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 METAP1P53582 386 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 NAGLUP54802 743 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ADPRHP54922 357 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 AP1S2P56377 157 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CDC16Q13042 620 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.94e-7■■■□□ 18.3
HDLBP-211ENST00000425989 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CPNE9Q8IYJ1 553 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ATL1Q8WXF7 558 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ASB11Q8WXH4 323 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ELMO1Q92556 727 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GLMNQ92990 594 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CCT7Q99832 543 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MECRQ9BV79 373 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FAM107BQ9H098 131 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PARVBQ9HBI1 364 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 THEGQ9P2T0 379 aa9.45□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.45□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 A8MT66 165 aa9.44□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 PLK4O00444 970 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FPGTO14772 594 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF10CO14798 259 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GIPC1O14908 333 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MATN4O95460 622 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ANXA5P08758 320 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 MTHFD2P13995 350 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GFAPP14136 432 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PCSK2P16519 638 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GABRG2P18507 467 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 NDUFV2P19404 249 aa9.44□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 KCNC1P48547 511 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PIK3CGP48736 1102 aa9.44□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 ARHGAP8P85298 464 aa9.44□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 SETDB1Q15047 1291 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TGFBIQ15582 683 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZSCAN26Q16670 478 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 PIM3Q86V86 326 aa9.44□□□□□ -0.9
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