RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408541.1

RNU6ATAC11P-201, Transcript of RNA, U6atac small nuclear 11, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6ATAC11P, Length 125 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MLYCDO95822 493 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MBD3O95983 291 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 F10P00742 488 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 GHRHP01286 108 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 C1QBP02746 253 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 TFP02787 698 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CHGBP05060 677 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ALDH2P05091 517 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PYGLP06737 847 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CD7P09564 240 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 RHOXF2BP0C7M4 288 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PIRTP0C851 137 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 DANCRP0C864 163 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ZNF24P17028 368 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ZNF28P17035 718 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PLCG1P19174 1290 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 SDSP20132 328 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CRYGSP22914 178 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CMA1P23946 247 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 GPTP24298 496 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 KLRC1P26715 233 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CDC25AP30304 524 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 NMT1P30419 496 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 OXTRP30559 389 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PKLRP30613 574 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ACSL1P33121 698 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 GRK5P34947 590 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 VHLP40337 213 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ADH7P40394 386 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 STAT3P40763 770 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MAGEB1P43366 347 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 SCTRP47872 440 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 OR1D4P47884 311 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 GLUD2P49448 558 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MAN2A2P49641 1150 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 GUCY2FP51841 1108 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MVDP53602 400 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CTSCP53634 463 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MFAP2P55001 183 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 KRTAP12-2P59991 146 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 RPL15P61313 204 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PPP2CBP62714 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PPP2CAP67775 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ARG2P78540 354 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 SORDQ00796 357 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ARID5AQ03989 594 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CACNG1Q06432 222 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 TGM3Q08188 693 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ADCY2Q08462 1091 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PDE4DQ08499 809 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 KCNA1Q09470 495 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 LMOD3Q0VAK6 560 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 LRMPQ12912 555 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PLD1Q13393 1074 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 FOXE3Q13461 319 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 RASGRF1Q13972 1273 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MESDQ14696 234 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 TEAD2Q15562 447 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 NFE2L2Q16236 605 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 HLFQ16534 295 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 DBN1Q16643 649 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CCDC38Q502W7 563 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 TEX44Q53QW1 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 PCOTHQ58A44 107 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 RILPL1Q5EBL4 403 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 FBXO47Q5MNV8 452 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ELFN2Q5R3F8 820 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MFSD14BQ5SR56 506 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 TTC39AQ5SRH9 613 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 FAM27D1Q5T7N8 215 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 TSTD2Q5T7W7 516 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 CYP4A22Q5TCH4 519 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 RNF220Q5VTB9 566 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 SUSD4Q5VX71 490 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 FAM205BPQ63HN1 556 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 FRG2Q64ET8 278 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 FAM90A2PQ658T7 463 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 ATG9BQ674R7 924 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 MBLAC2Q68D91 279 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 NADSYN1Q6IA69 706 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 SLC35E4Q6ICL7 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms