RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 H3BSA7 217 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 MMP2P08253 660 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TYRP14679 529 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 MPLP40238 635 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRIA1P42261 906 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 DGKEP52429 567 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 NAA20P61599 178 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ESRRGP62508 458 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARF5P84085 180 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 POU4F1Q01851 419 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 RELAQ04206 551 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 LMAN2Q12907 356 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLF10Q13118 480 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCSK7Q16549 785 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLK5Q496M5 336 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 CERCAMQ5T4B2 595 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEPROQ6NW34 567 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF597Q96LX8 424 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TREX1Q9NSU2 369 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRGBPQ9NV56 204 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBP1Q9NZI7 540 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 APPL1Q9UKG1 709 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TLK1Q9UKI8 766 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PKP3Q9Y446 797 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.86□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM114B3SHH9 223 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 H3BNH8 94 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF195O14628 629 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLIN3O60664 434 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ESRRBO95718 433 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADH5P11766 374 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TYK2P29597 1187 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ERFP50548 548 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 POU6F1Q14863 301 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PIGGQ5H8A4 983 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 C16orf46Q6P387 395 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 STRA8Q7Z7C7 330 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 CARM1Q86X55 608 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 KYQ8NBH2 561 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 RIN3Q8TB24 985 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 RDH11Q8TC12 318 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 HHIPQ96QV1 700 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHRAC1Q9NRG0 131 aa9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A087X1B8 175 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 WASH3PC4AMC7 463 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 H7C0S8 307 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 USP12O75317 370 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD9P21926 228 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 DPP6P42658 865 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 DGKGP49619 791 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTPAP49638 278 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAXP61244 160 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEPT6Q14141 434 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 DHCR24Q15392 516 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 BCL2A1Q16548 175 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 CARD16Q5EG05 197 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 IYDQ6PHW0 289 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 EPGNQ6UW88 154 aa9.84□□□□□ -0.83
APOBEC3G-201ENST00000407997 USP45Q70EL2 814 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms