RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 TRAF3Q13114 568 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC58Q4VC31 144 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RHEBL1Q8TAI7 183 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PPM1MQ96MI6 270 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ACTR8Q9H981 624 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa21.58■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 S1PR4O95977 384 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CD36P16671 472 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 FDXRP22570 491 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PRKCDQ05655 676 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CDK10Q15131 360 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF544Q6NX49 715 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ADHFE1Q8IWW8 467 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SIMC1Q8NDZ2 872 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF599Q96NL3 588 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ATOH8Q96SQ7 321 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SCN3BQ9NY72 215 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ORC6Q9Y5N6 252 aa21.57■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ARNTLO00327 626 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SLC7A4O43246 635 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CRCPO75575 148 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 NPR3P17342 541 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PRKACGP22612 351 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PRKG2Q13237 762 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 KCTD2Q14681 263 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SIGIRRQ6IA17 410 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 FIG4Q92562 907 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF560Q96MR9 790 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 COL1A2P08123 1366 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 OR2A25A4D2G3 310 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 FTH1P02794 183 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DCAF15Q66K64 600 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 OR8J3Q8NGG0 315 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.56■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 UNCXA6NJT0 531 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DFFAO00273 331 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RGS10O43665 173 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 NAT1P18440 290 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GGT5P36269 586 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GNG2P59768 71 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PARP16Q8N5Y8 322 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 OR52E4Q8NGH9 312 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GIPC2Q8TF65 315 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RHBDF1Q96CC6 855 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 RGS18Q9NS28 235 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 DDIT4Q9NX09 232 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ADGRE2Q9UHX3 823 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PEX5LQ8IYB4 626 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 OR2T11Q8NH01 316 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 TNIP3Q96KP6 325 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 INVSQ9Y283 1065 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 COL4A5P29400 1685 aa21.55■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MFN2O95140 757 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HLA-DQB2P05538 268 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MAGP20916 626 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HTR3AP46098 478 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PWP1Q13610 501 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 KDELC2Q7Z4H8 507 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 HIPK1Q86Z02 1210 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 OR2T12Q8NG77 320 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLDN5-201ENST00000403084 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms