RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPN2P17706 415 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 KELP23276 732 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 INCA1Q0VD86 236 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC9A4Q6AI14 798 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PQLC3Q8N755 202 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 FLCNQ8NFG4 579 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TEX47Q8TBZ9 253 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAMTS15Q8TE58 950 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CDK15Q96Q40 435 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52B2Q96RD2 323 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 F2P00734 622 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 NR2F6P10588 404 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 YAP1P46937 504 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MED27Q6P2C8 311 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ARL10Q8N8L6 244 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PYCR2Q96C36 320 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TEPSINQ96N21 525 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 NALCNQ8IZF0 1738 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 KAT6AQ92794 2004 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PCCBP05166 539 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 HCAR3P49019 387 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF132P52740 706 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MTPNP58546 118 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TAS2R41P59536 307 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SRP54P61011 504 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CAP1Q01518 475 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC34A3Q8N130 599 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PIH1D2Q8WWB5 315 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 RAD51AP1Q96B01 352 aa17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DPPA5A6NC42 116 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 THRBP10828 461 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GJA1P17302 382 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TOMM20Q15388 145 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ERICH5Q6P6B1 374 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 THAP5Q7Z6K1 395 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 NPY6RQ99463 290 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 LMAN2LQ9H0V9 348 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ALPIP09923 528 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TLE2Q04725 743 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 LIN52Q52LA3 116 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TPK1Q9H3S4 243 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PLGRKTQ9HBL7 147 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PNPLA8Q9NP80 782 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf109Q9NX04 203 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM233B4DJY2 109 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 FANCGO15287 622 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ASLP04424 464 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GPIP06744 558 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP4P55087 323 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SIRPB2Q5JXA9 342 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNDC8Q6A555 127 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf65Q8NCR3 313 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ROPN1LQ96C74 230 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 XYLT2Q9H1B5 865 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TMCC2O75069 709 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 FADS2O95864 444 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DGKGP49619 791 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 OSER1Q9NX31 292 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM81AQ8TBF8 368 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR60Q8WVS4 1066 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPN18Q99952 460 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DMTF1Q9Y222 760 aa17■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 H0YC42 278 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 DLX3O60479 287 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 IMPDH1P20839 514 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPK12P53778 367 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 EXD2Q9NVH0 621 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 A8MT66 165 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 UGT2B17O75795 530 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 NR4A1P22736 598 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 UTS2BQ765I0 119 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC13A3Q8WWT9 602 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB26Q9ULW5 256 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms