RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 RFC2P35250 354 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CASP5P51878 434 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 NUDT13Q86X67 352 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ALG3Q92685 438 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ADM5C9JUS6 153 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ITGA10O75578 1167 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 VIPP01282 170 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CBSLP0DN79 551 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CBSP35520 551 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MTHFRP42898 656 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 RPIAP49247 311 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF132P52740 706 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 PLD5Q8N7P1 536 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 OR4K2Q8NGD2 314 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MCFD2Q8NI22 146 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 AGAP11Q8TF27 550 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 KNTC1P50748 2209 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SPTLC1O15269 473 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SASH3O75995 380 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 TACR2P21452 398 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 HERVK_113P63132 956 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 GAD2Q05329 585 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ADNP2Q6IQ32 1131 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 IFNL1Q8IU54 200 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ERVK-6Q9BXR3 956 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF222Q9UK12 451 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 H0Y858 1186 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 HCAR3P49019 387 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CCR8P51685 355 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SLC5A3P53794 718 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 PRKAG1P54619 331 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 GNA12Q03113 381 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 DET1Q7L5Y6 550 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 WASH3PC4AMC7 463 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 WRBO00258 174 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CD52P31358 61 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 NUMBP49757 651 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MVKQ03426 396 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 IL18R1Q13478 541 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 RHBDF2Q6PJF5 856 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC107Q8WV48 283 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 C8orf48Q96LL4 319 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 TCF25Q9BQ70 676 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF879B4DU55 563 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ORC5O43913 435 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 DNASE1L1P49184 302 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 C9orf64Q5T6V5 341 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CEP68Q76N32 757 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 LCN9Q8WX39 176 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MAFFQ9ULX9 164 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 Q9Y3F1 56 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CACNA1CQ13936 2221 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SCN2BO60939 215 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 GABRR2P28476 465 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 OR1D2P34982 312 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CAPZA1P52907 286 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 ITGA7Q13683 1181 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 MSANTD2Q6P1R3 559 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 SNX33Q8WV41 574 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CST11Q9H112 138 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 HMGN1P05114 100 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRT-202ENST00000373184 UGT2B4P06133 528 aa5.95□□□□□ -1.46
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