RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMDEC1O15204 470 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TMC8Q8IU68 726 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLC9A6Q92581 669 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A4Q969I6 547 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PI15O43692 258 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TCEA3O75764 348 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 OR5F1O95221 314 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 COL6A1P12109 1028 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNA4P43681 627 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF846Q147U1 533 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 MCFD2Q8NI22 146 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HM13Q8TCT9 377 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 LPIN1Q14693 890 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 OAFQ86UD1 273 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FAM81AQ8TBF8 368 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 COX4I2Q96KJ9 171 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PCBD2Q9H0N5 130 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 IRAK3Q9Y616 596 aa20.03■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RGS10O43665 173 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PCCBP05166 539 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GPR33Q49SQ1 333 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 LCN9Q8WX39 176 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NT5EP21589 574 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HERVK_113Q902F9 699 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 MYOM1P52179 1685 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CREB1P16220 341 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 IL12AP29459 219 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 OMPP47874 163 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HCAR3P49019 387 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 BNC1Q01954 994 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF460Q14592 562 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CBR4Q8N4T8 237 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ING5Q8WYH8 240 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 COMMD9Q9P000 198 aa20.02■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RABGGTBP53611 331 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SNAPC1Q16533 368 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DNASE1L2Q92874 299 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FNIP2Q9P278 1114 aa20.02■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 C9JVG2 144 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL18O94889 574 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RASGRP1O95267 797 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN5P54829 565 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TEAD4Q15561 434 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRF1Q5T601 910 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A24Q6NUK1 477 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PAOXQ6QHF9 649 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CALML5Q9NZT1 146 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 A8MUI8 341 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 IL1R2P27930 398 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 IGFALSP35858 605 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PRR5P85299 388 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN11Q5T124 520 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 DCST1Q5T197 706 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LIX1Q8N485 282 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 H3BNX3 289 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CASKO14936 926 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A2O15244 555 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 UBR7Q8N806 425 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SQORQ9Y6N5 450 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLIT2O94813 1529 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.01■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 OR1F1O43749 312 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms