RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 SSX4O60224 188 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR137BO60478 399 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ENTPD3O75355 529 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF217O75362 1048 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LDLRP01130 860 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT19P08727 400 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NR2F1P10589 423 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ITGA2P17301 1181 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 HRH2P25021 359 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 DLX5P56178 289 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CD81P60033 236 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP2R2BQ00005 443 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 IGSF11Q5DX21 431 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 C9orf152Q5JTZ5 239 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SIRPB2Q5JXA9 342 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GCNT6Q5T4J0 391 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GSG1LQ6UXU4 331 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GFRALQ6UXV0 394 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ASB18Q6ZVZ8 466 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KCTD8Q6ZWB6 473 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM219Q86XT9 240 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF441Q8N8Z8 693 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 DMBX1Q8NFW5 382 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 OR5R1Q8NH85 324 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC20A1Q8WUM9 679 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SMPDL3BQ92485 455 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CD101Q93033 1021 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC22A18Q96BI1 424 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 RHBDF1Q96CC6 855 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC14Q96N46 770 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MS4A10Q96PG2 267 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NEK1Q96PY6 1258 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SEPHS2Q99611 448 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNK15Q9H427 330 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PDE7BQ9NP56 450 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MIOSQ9NXC5 875 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 IL17BQ9UHF5 180 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TSPYL4Q9UJ04 414 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PLAGL1Q9UM63 463 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 OR2W1Q9Y3N9 320 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM169AQ9Y6X4 670 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KIF26BQ2KJY2 2108 aa2.8□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TAF1P21675 1872 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM172BPA6NC97 362 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 J3QR06 171 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PLK4O00444 970 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CAPN9O14815 690 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CLIC2O15247 247 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC01565O15544 149 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PLPP2O43688 288 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SYNGR3O43761 229 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FGF17O60258 216 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT36O76013 467 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 AKR1B1P15121 316 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CBLP22681 906 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NMBRP28336 390 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ACSL1P33121 698 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PSMC4P43686 418 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ISL1P61371 349 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GRAPQ13588 217 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PCLAFQ15004 111 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TAF13Q15543 124 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SNAPC1Q16533 368 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM198Q66K66 360 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT80Q6KB66 452 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KLC3Q6P597 504 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM171BQ6P995 826 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF534Q76KX8 674 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXO39Q8N4B4 442 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 RFLNBQ8N5W9 214 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 POGLUT1Q8NBL1 392 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 OR13A1Q8NGR1 328 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 OR52I2Q8NH67 350 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 EXD1Q8NHP7 514 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.79□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PTERQ96BW5 349 aa2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms