RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361675.6

CALD1-201, Transcript of caldesmon 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CALD1, Length 3,612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1-201ENST00000361675 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 DAW1Q8N136 415 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RMDN3Q96TC7 470 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 NAT9Q9BTE0 207 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 C2orf40Q9H1Z8 148 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 AASSQ9UDR5 926 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 POLIQ9UNA4 740 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 DERAQ9Y315 318 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SMLR1H3BR10 107 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TRIM38O00635 465 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CIDEAO60543 219 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CYBBP04839 570 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TYK2P29597 1187 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PTGER2P43116 358 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SLC15A1P46059 708 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 DUSP4Q13115 394 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CBWD6Q4V339 395 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 HES5Q5TA89 166 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SLC6A19Q695T7 634 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 GK5Q6ZS86 529 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 MUS81Q96NY9 551 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 DSN1Q9H410 356 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TREM1Q9NP99 234 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 OBP2AQ9NY56 170 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RDH8Q9NYR8 311 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 GRHPRQ9UBQ7 328 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RIPK3Q9Y572 518 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 NFKBIEO00221 500 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TRIM24O15164 1050 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CCNE2O96020 404 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CD63P08962 238 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RD3LP0DJH9 198 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SLC12A1Q13621 1099 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 INPP5AQ14642 412 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SURF1Q15526 300 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 USP41Q3LFD5 358 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PIGZQ86VD9 579 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 MIB1Q86YT6 1006 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TFAP2CQ92754 450 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ASB16Q96NS5 453 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CSF3RQ99062 836 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ADPGKQ9BRR6 497 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 SIX2Q9NPC8 291 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 MAP10Q9P2G4 905 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ASB4Q9Y574 426 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.99□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 UPK1BO75841 260 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ETV4P43268 484 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 DSC2Q02487 901 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 BBS12Q6ZW61 710 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 METTL4Q8N3J2 472 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TRPV3Q8NET8 790 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 TEX46H3BTG2 121 aa8.98□□□□□ -0.97
CALD1-201ENST00000361675 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms